Le JRS Kenya gère deux maisons de protection temporaire pour les survivants de la violence sexuelle et de genre (SVGB) et pour les enfants ayant besoin de protection, offrant une gestion complète des cas, un soutien psychosocial et une formation professionnelle. Ces services aident à atteindre la stabilité et à développer les compétences nécessaires à la transition vers une situation plus durable.

Le JRS Kenya gère également cinq centres de protection pour les besoins spéciaux, où les individus peuvent accéder à des services psychosociaux et où leurs parents/soignants peuvent recevoir des conseils et une formation. Le JRS continue d’opérer des centres de protection pour les personnes handicapées, offrant des services essentiels, un soutien psychosocial, et menant des actions de proximité pour identifier davantage de personnes handicapées confinées à domicile.